Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NOTOA8MTQ0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms