Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POTEMA6NI47 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms