Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms