Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms