Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms