Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms