Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms