Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms