Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPUSD1Q9UJJ7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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