Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDRG3Q9UGV2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms