Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACFD1Q9UGQ2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms