Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DUX4Q9UBX2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms