Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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