Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms