Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms