Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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