Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms