Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKIRAS2Q9NYR9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKIRAS2Q9NYR9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS2Q9NYR9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS2Q9NYR9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS2Q9NYR9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS2Q9NYR9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS2Q9NYR9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS2Q9NYR9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS2Q9NYR9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS2Q9NYR9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS2Q9NYR9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS2Q9NYR9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS2Q9NYR9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms