Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RDH8Q9NYR8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RDH8Q9NYR8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RDH8Q9NYR8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RDH8Q9NYR8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RDH8Q9NYR8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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