Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22■■□□□ 1.11
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