Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRKQ9NRH2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms