Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE3Q9NRF9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms