Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRM3Q9NNZ6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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