Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLVAPQ9BX97 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms