Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms