Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3R4Q99570 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3R4Q99570 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms