Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms