Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms