Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms