Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms