Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCMH1Q96GD3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms