Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTRA1Q92743 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms