Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRUQ92729 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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