Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLF2Q8IX21 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms