Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms