Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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