Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms