Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5Y7

KCTD20, BTB/POZ domain-containing protein KCTD20, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD20Q7Z5Y7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCTD20Q7Z5Y7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms