Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms