Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms