Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS3Q68E01 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS3Q68E01 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms