Protein–RNA interactions for Protein: Q68D10

SPTY2D1, Protein SPT2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTY2D1Q68D10 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTY2D1Q68D10 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms