Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGNBP1Q5YKI7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGNBP1Q5YKI7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GGNBP1Q5YKI7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGNBP1Q5YKI7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGNBP1Q5YKI7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms