Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FAM78BQ5VT40 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FAM78BQ5VT40 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FAM78BQ5VT40 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FAM78BQ5VT40 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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