Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC01545Q5VT33 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms