Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms