Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF8Q3BBV2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms