Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC57Q2TAC2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms