Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MICAQ29983 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MICAQ29983 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MICAQ29983 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MICAQ29983 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MICAQ29983 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MICAQ29983 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MICAQ29983 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MICAQ29983 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MICAQ29983 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MICAQ29983 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MICAQ29983 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MICAQ29983 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MICAQ29983 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MICAQ29983 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MICAQ29983 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MICAQ29983 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MICAQ29983 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms