Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms